Стенка кишечника расслаивается снаружи внутрь на плазматический слой, пластинку проприи, поверхностную пластинку проприи, подслизистый слой, слизистую оболочку и слизисто-мышечный слой. Кишечная стенка относительно тонкая, и точная толщина стенки варьируется в разных местах. Поэтому эндоскопическое лечение кишечной стенки такой толщины требует высокой степени внимания для предотвращения возможности перфорации. В случае полипов в кишечной стенке большинство из них возникает в слизистом слое или в мышечном слое слизистой оболочки. Если имеется гладкомышечная опухоль, она обычно возникает в подслизистом слое и в некоторых случаях может достигать lamina propria.