Естественный дефицит йода в окружающей среде означает недостаточное содержание йода в почве и воде. Существуют три основные причины естественного дефицита йода в окружающей среде: 1. Примерно во время четвертичного оледенения, когда ледники растаяли и ледяная вода смыла большое количество богатой йодом зрелой почвы. Содержание йода в новой почве, образовавшейся из обнаженной породы, составляет лишь четверть от содержания йода в исходной зрелой почве, что привело к дефициту йода в окружающей среде в большинстве регионов мира, который является основной причиной дефицита йода в природной среде; 2. Йод выщелачивается и теряется в больших количествах, это явление более выражено в горных районах.