Неприятный запах изо рта связан с заболеваниями желудочно-кишечного тракта, горла и полости рта. Существует множество заболеваний желудочно-кишечного тракта, которые могут привести к появлению неприятного запаха изо рта, например хронический гастрит, язва желудка, диспепсия и т.д. Эти заболевания приводят к замедлению перистальтики желудка, пища в желудке и пищеварительные соки вступают в реакцию, в результате чего появляется кислый и гнилостный вкус и через пищевод выходит наружу, особенно в желудке у пациентов, зараженных бактерией Helicobacter pylori, у большинства изо рта будет присутствовать неприятный привкус. У некоторых людей гнойный фарингит может приводить к образованию большого количества гнойного материала в горле, что вызывает неприятный запах изо рта. У некоторых людей неприятный запах изо рта вызван заболеваниями полости рта, например, язвы во рту, гингивит, пародонтит и другие заболевания обычно сопровождаются неприятным запахом изо рта, эти заболевания приводят к тому, что десны содержат гниющие вещества, поэтому они будут издавать неприятный запах.