Клетки слизистой оболочки, составляющие желудок, не являются возобновляемыми клетками, и после гастрэктомии они не отрастают, независимо от того, выполнена ли резекция большей части желудка или полная резекция. После гастрэктомии у подавляющего большинства пациентов остаются симптомы рефлюкса, такие как изжога, кислотный рефлюкс, у некоторых пациентов даже появляется горький привкус во рту, поэтому пациентам может потребоваться длительный прием препаратов, подавляющих секрецию желудочной кислоты, динамика желудочно-кишечного тракта, а также препараты для защиты слизистой оболочки желудка. Основными рекомендуемыми препаратами для подавления желудочной секреции кислоты являются ингибиторы протонной помпы, также могут приниматься антагонисты Н2-рецепторов. Ингибиторы протонной помпы — это в основном омепразол, пантопразол и др. В качестве диуретиков могут использоваться морбуталин или триметоприм и т.д. В качестве протектантов слизистой оболочки желудка обычно рекомендуются карбонат алюминия магния или тиосульфат алюминия.