Лучшим временем для проведения амниоцентеза обычно являются 16-24 недели беременности, оптимальная гестационная неделя — 20-22 недели. Клетки амниотической жидкости получают из клеток плода и клеток фетальной оболочки, и количество фетальных клеток является ключевым фактором успеха культуры. Если количество фетальных клеток, полученных при амниоцентезе, не гарантировано слишком рано или слишком поздно, успех культуры может быть поставлен под угрозу. Если культура не удалась, потребуется повторный амниоцентез. Если плацента расположена на передней стенке матки и интраоперационный доступ затруднен, может потребоваться прохождение через плаценту, вызывающее кровотечение, поэтому рекомендуется соответствующим образом продлить время пункции, отложив ее на 1-2 недели.