Аутоиммунное заболевание щитовидной железы — это в основном хронический лимфоцитарный тиреоидит, для которого не существует специфического лечения. Пациенты с относительно небольшой щитовидной железой и без явных признаков давления могут находиться под тщательным наблюдением и контролем. Для пациентов со значительно увеличенной щитовидной железой с симптомами давления можно использовать таблетки левотироксина для лечения зоба, который затем может медленно уменьшаться. Пациентам с гипотиреозом требуется заместительная терапия гормонами щитовидной железы. После одного года лечения левотироксином примерно у 1/3 пациентов можно ожидать, что функция щитовидной железы вернется в нормальный диапазон.