Подавляющее большинство медикаментозных абортов оказываются эффективными, поскольку продукты беременности изгоняются в период от 2 до 6 часов после введения мизопростола, а в некоторых случаях — до 1 недели после введения препарата. В клинической практике известны случаи неудачного медикаментозного аборта с использованием комбинации мифепристона и мизопростола, когда эмбрион оставался жизнеспособным на УЗИ через 1 неделю и наблюдалась примитивная трубная пульсация сердца. В этом случае речь идет о неудачном медикаментозном аборте, и следующим шагом является прерывание беременности — либо болезненный, либо безболезненный аборт. Аборт не во всех случаях эффективен на 100%, и в некоторых из них может не получиться.