Лечение глазного архонуклеоза включает в себя медикаментозную и хирургическую терапию. Большинство пациентов могут быть вылечены вышеперечисленными методами и в основном не рецидивируют, но прогноз зрения хуже у пациентов, у которых повреждена сетчатка в месте поражения. В медикаментозном лечении обычно используются глюкокортикостероиды и антгельминтики. Глюкокортикостероиды, такие как таблетки метилпреднизолона, используются для борьбы с воспалением. Однако применение глюкокортикостероидов в больших дозах может привести к снижению иммунитета, что чревато инфекциями. Дегельминтики, такие как таблетки мебендазола и альбендазола, помогают изгнать круглых червей токсоплазмы. У некоторых пациентов могут наблюдаться побочные реакции, такие как тошнота и рвота. Хирургическое лечение в основном заключается в витрэктомии для удаления пораженного участка, а затем в зависимости от состояния пациента назначается сгущающее лечение. Лучшее время для операции — до гибели личинок и до развития воспаления в организме. Без стандартного лечения болезнь может привести к слепоте, а также к различным осложнениям; при стандартном лечении большинство пациентов можно вылечить, но у пациентов с макулярными поражениями или тракционной отслойкой сетчатки прогноз для зрения хуже.