Причин тонкого эндометрия и скудных менструаций много, большинство из них связано с отсутствием нормальной овуляции или снижением функции яичников, что приводит к низкому уровню эстрогенов в организме, что может влиять на фертильность или количество и цвет менструаций. При повторных выскабливаниях или абортах может повреждаться базальный слой эндометрия, что приводит к образованию эндометриоидных рубцов или даже спаек в матке, которые также могут быть причиной скудных менструаций и подлежат восстановлению хирургическим путем. Некоторые воспалительные заболевания, такие как обычный эндометрит или туберкулез органов малого таза, могут проникать в эндометрий, нарушая его рост и приводя к застою и отеку эндометрия, поэтому заболевания, вызывающие скудные менструации, необходимо лечить в зависимости от их причин.