Детям обычно не нужно принимать пробиотики в течение длительного времени, прием пробиотиков ограничивается примерно 3-6 месяцами максимум, пробиотики являются наиболее важным компонентом микроэкосистемы кишечника человека, пробиотики обычно принимаются, когда у ребенка есть дефицит пробиотиков, особенно для микроэкосистемы в возрасте до 2 лет не очень хорошо установлено, прием пробиотиков полезен для физического и психического здоровья и восстановления болезни. Существует также дисбаланс или дефицит в микроэкосистеме кишечника, обычно из-за факторов болезни, особенно острых и хронических желудочно-кишечных инфекций, которые могут привести к нарушению микроэкосистемы кишечника, и в это время лучше принимать пробиотики. Как правило, пробиотики можно принимать в течение 1 недели после исчезновения клинических симптомов и признаков. Некоторые люди с хроническими иммунными или аллергическими заболеваниями могут принимать пробиотики в течение более длительного периода времени, но не более 3 месяцев.