ЭКО второго поколения — это метод интрацитоплазматической микроинъекции единичных сперматозоидов в ооциты для содействия зачатию. ЭКО второго поколения подходит для мужчин с тяжелой олигозооспермией, слабыми и деформированными сперматозоидами, необратимой обструктивной азооспермией, такой как врожденное отсутствие семявыносящих протоков, закупорка семявыносящих протоков вследствие инфекции и т.д. Кроме того, ЭКО второго поколения может быть использовано, когда ЭКО первого поколения неоднократно не удавалось оплодотворить сперматозоиды, и процент оплодотворения очень низкий, и т.д. ЭКО второго поколения — это метод микрооплодотворения, разработанный на основе экстракорпорального переноса эмбрионов в ЭКО первого поколения, при котором сперматозоиды вводятся непосредственно в цитоплазму яйцеклетки для завершения оплодотворения, а процесс после оплодотворения фактически такой же, как и при ЭКО первого поколения. Он был разработан в основном для решения проблемы мужского бесплодия.