Легкую атипичную гиперплазию можно лечить суппозиториями на основе повидона. В случае умеренной или тяжелой гиперплазии сквамозного эпителия большинство случаев связано с развитием поражений шейки матки. Если женщина молода и имеет детородный потенциал, ее можно лечить с помощью лекарств или конизации шейки матки. У пожилых женщин с выраженной гиперплазией сквамозного эпителия предпочтительнее хирургическое лечение — конизация шейки матки или полное иссечение. Атипичная сквамозная эпителиальная гиперплазия — это злокачественная тенденция сквамозного эпителия, и существует 50% вероятность того, что легкая атипичная гиперплазия станет нормальной, в то время как более тяжелая гиперплазия, оставленная без лечения, может легко привести к раку шейки матки.