После пяти лет приема препаратов для лечения ВИЧ-инфекции, как правило, не возникает значительных побочных эффектов, однако у некоторых людей могут наблюдаться нарушения функции печени и почек, сонливость, кожные высыпания и т.д. Противовирусные препараты для лечения ВИЧ-инфекции необходимо применять в течение длительного времени, и при длительном применении возникают определенные побочные эффекты. Необходимо ли сменить препарат или прекратить его прием, следует решать по рекомендации врача. Нуклеозидные противовирусные препараты, такие как тенофовир, хотя и имеют слабые побочные эффекты, при длительном применении влияют не только на почки, но и на обмен кальция и фосфора, поэтому во время применения препаратов необходимо контролировать функцию почек. При применении препарата эфавиренз и других ненуклеотидных ингибиторов антитранскриптазы возможны сонливость, бессонница и другие неврологические симптомы. Ингибиторы протеазы, такие как лопинавир, на ранних стадиях склонны к нарушению липидного обмена и диарее. При заболевании СПИДом необходимо активно обращаться за медицинской помощью, а препараты применять рационально в соответствии с рекомендациями врача.