В целом у пациентов с хордомой есть две конечные причины смерти: во-первых, поскольку хордома продолжает увеличиваться в размерах, сдавливая окружающие ткани, особенно если она давит на ствол мозга, то постепенно формируется нарушение сознания, от вялости до летаргии и комы, и, что более серьезно, это может привести к нарушению дыхания и кровообращения, а затем к смерти пациента, что является наиболее важной причиной смерти из-за постоянного роста и сдавливания хордомы. Это наиболее важная причина смерти, которая обусловлена непрерывным ростом и сдавливанием хордомы. Во-вторых, хордома разъедает череп, что может привести к повреждению носоглоточной полости и других частей тела, в результате чего происходит утечка спинномозговой жидкости из носа или стенки глотки, может возникнуть ретроградная инфекция, что приводит к смерти от хордомы. Существуют и другие факторы, в том числе длительное отсутствие лечения, что может привести к нарушению работы эндокринной системы, нарушение всасывания нормальных питательных веществ, что может привести к истощению организма, неправильное питание, что может привести к потере веса, и другие факторы.