Транскраниальная допплерография и МРТ головного мозга — это два совершенно разных исследования, которые обычно не сравнивают друг с другом. Первое в основном используется для уточнения кровотока в мозге, например, нет ли замедления кровотока в сосудах или сужения сосудов, что приводит к недостаточному кровоснабжению мозга. Оно также может использоваться для уточнения причины цереброваскулярных заболеваний, наличия сосудистых мальформаций или аневризм, а также образования микроэмболического дождя. Однако МРТ обычно используется для определения наличия органических заболеваний в головном мозге, в основном для того, чтобы увидеть, есть ли какие-либо поражения в паренхиме мозга, и может выявить острый церебральный инфаркт, кровоизлияние в мозг, опухоли мозга, энцефалит и другие заболевания. Кроме того, если дополнительно проводятся функциональная МРТ и ангиография, они могут помочь уточнить наличие метаболических нарушений в мозге и наличие поражений церебральных сосудов. В целом МРТ головного мозга с визуализацией артериальной системы и визуализацией венозной системы более точно, чем транскраниальное цветное допплеровское ультразвуковое исследование, позволяет рассмотреть кровеносные сосуды, но не помогает определить наличие микроэмболического дождя и не помогает предсказать частоту возникновения инфаркта головного мозга.