Амниоцентез следует проводить не позднее 20 недель беременности. Если он проводится после 20 недель, объем амниотической жидкости уменьшается, а плод значительно увеличивается в размерах, что облегчает пункцию плода в это время и повышает риск прокола. Нормальное время для амниоцентеза — между 16 и 20 неделями беременности, когда объем амниотической жидкости высок, а плод относительно мал, он плавает в амниотической жидкости и защищен большим количеством амниотической жидкости. Хромосомное исследование может быть проведено в период 16-20 недель беременности посредством исследования амниотической жидкости, что полезно для диагностики генетических заболеваний, а также для генетической диагностики ДНК, когда результаты относительно точны и могут определить, нормально ли развивается плод.