Основной причиной вонючего пупка является воспаление пупка, вызванное бактериальной инфекцией. Из внутренней части пупка сочится и может выделяться гной, который и вызывает неприятный запах. В пупке также может быть экзема, вызванная выделениями с поверхности. Основной причиной экземы может быть аллергия, например, от ношения одежды из химических волокон. При появлении экземы рекомендуется не ковырять ее руками. Следует сменить белье на хлопчатобумажное и применять гормональные или антигистаминные препараты для лечения симптомов. Антибиотические мази, такие как офлоксацин, также можно применять, если поверхность экземы нарушена, покраснела или опухла и есть подозрение на инфекцию.