Генотипы HBV можно разделить на 8 типов A, B, C, D, E, F, G и H. Распространение генотипов HBV в разных частях мира различно: тип A распространен во всем мире, типы B и C — в основном в Азии, тип D — в Америке, Южной Европе, Австралии и на Ближнем Востоке, тип E — в основном в Африке, тип F — у коренных жителей Америки и Полинезии, тип G — в Америке, а тип H найденные в Соединенных Штатах. В Китае в 284 случаях хронической инфекции HBV генотипический состав был в основном с-типа и В-типа, с 73,2% С-типа и 26,2% В-типа, соответственно, и только по одному случаю D-типа и смешанного В и С-типа. В районе к югу от реки Янцзы генотип В преобладал в 55% случаев, в то время как на севере от реки Янцзы генотип С преобладал в 81,6% случаев. Генотип C распространен по всей стране, в то время как генотипы E, F, G и H не встречаются в Китае.