Боль в кишечнике обычно возникает вокруг пупка, который является средней частью кишечника, включающего тощую, подвздошную, ободочную и прямую кишку. Когда возникает боль в кишечнике, на локализацию боли может влиять наличие поражений в различных отделах кишечного тракта. Поскольку тощая и подвздошная кишки тонкого кишечника расположены в основном вокруг пупка, при поражении тонкого кишечника основным проявлением является боль вокруг пупка. Толстая кишка находится на периферии тонкой кишки, поэтому при поражении толстой кишки боль возникает дистальнее пупка. Когда поражение не происходит в восходящей ободочной кишке, основным местом боли является правая сторона живота, когда поражение происходит в поперечной ободочной кишке, боль в основном возникает в поперечной части верхней части живота, а при поражении нисходящей ободочной кишки основным местом боли является правая сторона живота. Аппендикс также является частью кишечного тракта, и когда он воспаляется, это также может вызвать боль в кишечнике, в основном в правой нижней части живота. При заболеваниях кишечника в сигмовидной и прямой кишке боль возникает преимущественно в левой нижней части живота.