Наиболее эффективным методом лечения подкожных кист является хирургическое вмешательство, которое может быть выполнено пациентом под местной или внутривенной анестезией. В случае больших подкожных кист при необходимости также требуется подготовка к пересадке кожи. Киста относится к распространенным доброкачественным заболеваниям, вероятность рецидива после ее хирургического иссечения очень мала, при операции необходимо уделять внимание гемостазу, а кистозное поражение будет полностью удалено и иссечено. После операции необходимо провести дренирование большой остаточной полости, чтобы избежать образования гематомы или выпота, и наложить местное давление и повязку; после операции в соответствии с потребностями состояния назначаются препараты для профилактики инфекции, регулярно проводится смена лекарств. Многие кисты связаны с травмой, кроме того, существует определенный генетический фактор. Обычно ситуацию проясняет физикальное обследование, при необходимости может быть проведена компьютерная томография головы и другие визуализирующие исследования.