Во время экстракорпорального извлечения яйцеклеток регистрируется размер и количество фолликулов в каждом фолликуле, проколотом пункционной иглой для извлечения яйцеклеток, а аспирированная фолликулярная жидкость исследуется микроскопически на предмет наличия в ней яйцеклеток.
Извлечение яйцеклеток in vitro контролируется с помощью УЗИ, и врач, извлекающий яйцеклетки, обычно измеряет размер каждого фолликула и записывает его перед пункцией фолликула в яичнике для аспирации. Каждый пунктированный фолликул записывается, и эти записи можно найти в медицинской карте процедуры извлечения яйцеклетки.
После пункции каждого фолликула с помощью отрицательного давления производится аспирация фолликулярной жидкости, и аспирированная фолликулярная жидкость отправляется в лабораторию. В лаборатории аспирированную фолликулярную жидкость помещают под микроскоп, ищут в ней яйцеклетки, извлекают их для оплодотворения и регистрируют количество полученных яйцеклеток.