Целиакия может быть клинически излечена путем активного формального лечения, но также следует обратить внимание на диету и образ жизни. При целиакии следует в первую очередь скорректировать структуру питания, избегать острых стимулов, холодной и жирной пищи. При наличии инфекции Helicobacter pylori необходимо пройти курс четверной терапии, следуя указаниям врача принимать омепразол, амоксициллин, метронидазол, таблетки висмута цитрата калия и другие препараты, полностью искоренить Helicobacter pylori, при сочетании с кровотечением из верхних отделов желудочно-кишечного тракта необходимо также рассмотреть возможность эндоскопического хирургического лечения. Прогноз при коэлиакии желудка после активного лечения обычно благоприятный, а процент излечения высокий. Однако, если не начать своевременное лечение, заболевание может осложниться перфорацией желудка и раком желудка, что негативно скажется на качестве жизни.