Неизвестно, почему возникают дефекты межпредсердной перегородки, но некоторые врожденные пороки сердца имеют семейный характер и иногда сопровождаются другими генетическими проблемами, например синдромом Дауна. Кроме того, некоторые состояния, возникающие во время беременности, могут повысить риск развития у плода дефекта межпредсердной перегородки, в том числе: 1. заражение вирусом краснухи: заражение краснухой, например, немецкой корью, в первые месяцы беременности повышает риск развития у плода порока сердца. 2. употребление наркотиков, табака, алкоголя или воздействие некоторых веществ: употребление некоторых наркотиков, курение, употребление алкоголя или наркотиков, таких как кокаин, во время беременности может нанести вред развивающемуся плоду. 3. диабет или волчанка: наличие диабета или волчанки может повысить риск развития пороков сердца у плода. Дефекты межпредсердной перегородки могут быть вызваны сочетанием генетических и экологических факторов. Пациентам с точно установленным диагнозом «дефект межпредсердной перегородки» следует обратиться за дополнительной медицинской помощью.