Организм полагается на собственный иммунитет для очищения от вируса, который является главной силой в борьбе с HBV, а существующие препараты против вируса гепатита В играют вспомогательную и облегчающую роль. Инфекцию HBV можно разделить на четыре периода: иммунная толерантность, иммунный клиренс, неактивный статус носителя HBsAg и, в меньшинстве случаев, реактивация. Период иммунной толерантности более длителен при передаче вируса от матери ребенку и при заражении HBV в раннем детстве, когда уровень ДНК HBV высок, а HBeAg положителен, но АЛТ и АСТ долгое время остаются на нормальном уровне, Обычно считается, что противовирусное лечение более эффективно, когда уровень АЛТ выше 80 МЕ/л без влияния ферментопонижающих препаратов, но в Китае существует клинический феномен субклинического прогрессирующего хронического гепатита В. Противовирусное лечение должно сочетаться с визуализацией и клинической оценкой. Иммуноклиренс является целью текущего лечения, если противовирусная терапия эффективна, HBeAg меняется с положительного на отрицательный, анти-HBe отрицательный на положительный, HBV DNA снижается до уровня <105 cps/mL, ALT и AST возвращаются к норме, и человек переходит в статус неактивного носителя HBsAg. У большинства людей этот период может оставаться стабильным в течение длительного времени, но у небольшого числа пациентов может наступить период реактивации, который может происходить двумя путями: либо в результате длительного иммунного стресса, когда вирус развивает мутации промоторов pre-C и C и постепенно переходит в HBeAg-негативный хронический гепатит B, либо в результате повторной HBeAg-позитивности, когда АЛТ и АСТ повышаются, а ДНК HBV >105 кпс/мл, что снова требует противовирусной терапии. Поэтому для неактивных носителей HBsAg в качестве меры предосторожности каждые шесть месяцев под длительным наблюдением врача следует проверять функцию печени, количественное определение ДНК HBV, АФП и УЗИ печени и селезенки.