Продолжительность лечения шоколадных кист яичников зависит от размера кисты, от того, односторонняя она или двусторонняя, от возраста пациентки, а также от того, есть ли у пациентки требования к фертильности. Если шоколадная киста яичника менее 4 см в диаметре и у пациентки нет симптомов и требований к фертильности, ее можно временно наблюдать. Если шоколадная киста яичника имеет диаметр >4 см, рекомендуется операция по удалению шоколадной кисты яичника. Однако, если у пациентки есть требования к фертильности и она бесплодна, операция по удалению кисты яичника не рекомендуется и может быть рассмотрена после извлечения яйцеклетки. Если шоколадная киста яичника имеет размер >4 см и у пациентки нет требований к фертильности, лапароскопическое удаление кисты следует проводить примерно через 7-8 дней после менструации. План лечения шоколадных кист яичников относительно сложен, и не только после операции, так как процент рецидивов высок, и часто после операции или пункции следует медикаментозное лечение для предотвращения рецидивов. Точное лекарство, используемое для профилактики рецидивов, зависит от того, есть ли у пациентки дальнейшие требования к фертильности, а также от ее возраста. Если пациентка приближается к менопаузальному возрасту, возможно, удастся предотвратить рецидив на более короткий период времени с помощью предварительного приема некоторого количества прогестерона. Если пациентка еще относительно молода, около 40 лет, может быть рекомендован препарат ГнРГ-а для предотвращения рецидива шоколадной кисты на период 3-6 месяцев.