Прогноз при коарктации спинного мозга зависит от основной причины, степени неврологических нарушений, а также от расположения и протяженности полости. Пациенты с умеренными и тяжелыми неврологическими нарушениями имеют худший прогноз, чем пациенты с легкими нарушениями. Реакция на лечение центральной кавитации плохая. Естественное течение спинальной кавитации неизвестно. По данным более старой литературы, 20% пациентов умирают в среднем в возрасте 47 лет. Смертность может снижаться благодаря повышению уровня хирургического вмешательства и совершенствованию методов лечения осложнений, связанных с параличом.