Инкубационный период — это период времени между появлением первых признаков и симптомов и проникновением патогена в организм. Для различных заболеваний инкубационный период варьируется от нескольких часов до месяцев или лет. Например, инкубационный период при птичьем гриппе у домашней птицы составляет от нескольких часов до нескольких дней и может достигать 21 дня. У людей инкубационный период птичьего гриппа обычно составляет менее 7 дней. Инкубационный период при атипичной пневмонии обычно составляет 4-10 дней, при этом самый короткий клинически зарегистрированный случай составляет 1 день, самый длинный — 20 дней, а в некоторых редких случаях даже 28 дней. Инкубационный период обычно считается связанным с типом инфицированного вируса, патогенностью вируса, количеством вирусов, путем заражения, иммунитетом инфицированного организма и другими нефизиологическими факторами. Например, инкубационный период ВИЧ-инфекции при переливании крови обычно относительно короткий, поскольку доза обычно выше, в то время как инкубационный период ВИЧ-инфекции при половом контакте относительно длительный, поскольку доза меньше. Инкубационный период после заражения ВГВ обычно составляет от 20 дней до 6 месяцев, по некоторым данным 28-160 дней, в среднем 70-80 дней; инфекция ВГС обычно имеет более мягкую клиническую картину, часто субклиническую, но инкубационный период при заражении после переливания крови обычно составляет от 20 дней до 6 месяцев, по некоторым данным 2-26 недель, в среднем 8 недель; ВИЧ-инфекция обычно связана с более длительным инкубационным периодом. Острые признаки и симптомы могут проявиться в течение 1-2 месяцев после заражения ВИЧ, после чего наступает более длительный бессимптомный период, продолжающийся 6-15 лет, в среднем 8-10 лет, который может быть сокращен до 1-5 лет при массивных переливаниях крови. Инкубационный период сифилиса обычно составляет 2-4 недели. Период окна — это период после заражения, когда вирус присутствует в крови до тех пор, пока не будет обнаружено достаточное количество соответствующего вирусного маркера (антигена или антитела). В это время соответствующие антигенные маркеры или антитела в сыворотке крови отсутствуют. Период окна различен для каждого вируса и обычно называется временем, когда обнаруживаются антитела к вирусу, но существует также период окна для тестирования антигена и нуклеиновых кислот, но он намного короче. Период окна для HBV, HCV и ВИЧ составляет 56, 70 и 22 дня соответственно, а для антигена P24 период окна составляет в среднем 15 дней, в то время как применение технологии нуклеиновых кислот сокращает период окна для HBV, HCV и ВИЧ до 41, 12 и 11 дней соответственно. Считается, что при наличии различных тестируемых вирусных маркеров, усовершенствованных методов обнаружения, новых реагентов и повышенной чувствительности период «окна» может быть значительно сокращен.