Сложные фебрильные судороги улучшаются после систематического лечения как причины, так и симптомов, но шансы на улучшение и излечение не очень высоки в относительном выражении. Сложные фебрильные судороги не поддаются полному излечению в силу следующих факторов: во-первых, возраст начала заболевания относительно молодой, чаще всего они возникают у детей в возрасте 6-10 лет; во-вторых, температура тела во время судорог в основном высокофебрильная, чаще всего температура тела составляет 38,5-39,5°C; в-третьих, при сложных фебрильных судорогах активные движения тела ограничены, а продолжительность судорог обычно составляет 0,25-24 часа. В-третьих, при сложных фебрильных судорогах наблюдается ограниченная инициатива тела, судороги обычно длятся 0,25-24 часа и сопровождаются аномалиями ЭЭГ. Поэтому прогноз при сложных фебрильных судорогах относительно неблагоприятный, и существует 1-2% вероятность того, что они перерастут в эпилепсию. Однако при комбинированном систематическом лечении неврологии и хирургии головного мозга, раннем лечении в начальной стадии судорог и сочетании симптоматического и причинного лечения процент излечения сложных фебрильных судорог остается высоким.