Язва желудка и H. pylori должны лечиться одновременно, и лекарства, используемые для лечения обоих заболеваний, частично совпадают. H. pylori можно уничтожить с помощью стандартной тройной терапии, например, тройная терапия амоксициллин плюс кларитромицин плюс рабепразол может быть выбрана для уничтожения H. pylori перорально в течение курса обычно 10-14 дней. По окончании курса лечения прием рабепразола продолжается, и для продолжения лечения язв желудка могут быть добавлены протекторы слизистой желудка, такие как коллоидный пектин висмута и алюминат висмута, лечение которых должно продолжаться примерно до 6 недель. Все лечение должно сопровождаться дыхательным тестом на углерод 14, чтобы проверить, убиты ли бактерии H. pylori, а также гастроскопией, чтобы проверить, заживает ли язва.