Бактериологическое исследование мокроты является надежным показателем эффективности и инфекционности туберкулеза. Обычно после 2-3 месяцев регулярного лечения больных туберкулезом с множественной лекарственной устойчивостью количество бактерий в мокроте может значительно уменьшиться, в то время как для достижения отрицательного бактериологического исследования мокроты больных продолжительность лечения обычно составляет не менее 6 месяцев. Во время лечения туберкулеза с множественной лекарственной устойчивостью клинически рекомендуется, чтобы пациенты ежемесячно сдавали мокроту на культуру Mycobacterium tuberculosis, что, в свою очередь, позволяет определить эффективность лечения на основании количества бактерий в мокроте и отрицательности результатов анализа, а также способствует своевременному внесению изменений в план лечения пациента. В то же время, многие пациенты в клинических условиях спрашивают, заразны ли они еще и нужно ли им продолжать изолироваться от семьи, а клинический ответ может быть основан только на результатах культивирования мокроты пациента. В культуре Mycobacterium tuberculosis могут быть выращены только живые бактерии.