Положительный результат HLA-B27 является лишь одним из референсных показателей для диагностики анкилозирующего спондилита. Частота HLA-B27 положительных пациентов с анкилозирующим спондилитом достигает 90-96%, в то время как частота HLA-B27 положительных пациентов в общей популяции составляет всего 4-9%; заболеваемость анкилозирующим спондилитом у HLA-B27 положительных пациентов составляет около 10%-20%, в то время как заболеваемость в общей популяции составляет 1‰-2‰, разница примерно в 100 раз. Все это позволяет предположить, что HLA-B27 является важным фактором в развитии анкилозирующего спондилита. Однако следует отметить, что, с одной стороны, не у всех HLA-B27-положительных пациентов развивается спондилоартропатия, а с другой стороны, примерно у 5%-20% пациентов со спондилоартропатией тест на HLA-B27 отрицательный, что позволяет предположить наличие других факторов, помимо генетических, влияющих на развитие АС. Анкилозирующий спондилит не возникает у 80% HLA-B27-положительных людей, в то время как 10% пациентов с анкилозирующим спондилитом являются HLA-B27-отрицательными. Поэтому HLA-B27-положительный не обязательно означает, что анкилозирующий спондилит имеет место, равно как и HLA-B27-отрицательный не означает, что анкилозирующий спондилит не имеет места, не говоря уже о том, что HLA-B27-положительный означает анкилозирующий спондилит.