Диагноз туберкулеза может быть поставлен пациентам с отрицательной мокротой, у которых мокрота отрицательна несколько раз, в случае совершенствования других обследований и исключения других заболеваний. Также необходимо противотуберкулезное лечение. Схема противотуберкулезного лечения включает рифампин, изониазид, этамбутол и пиразинамид, а КТ легких следует пересмотреть примерно через 1-2 месяца противотуберкулезного лечения, чтобы наблюдать за изменениями рассасывания поражений, а также регулярно проходить амбулаторное наблюдение и регулярно проверять функцию печени и почек, чтобы наблюдать за побочными реакциями на лекарства. Если после противотуберкулезного лечения у пациента происходит рассасывание очагов поражения, это также подтверждает наличие туберкулеза. Клинический диагноз мокротоотрицательного туберкулеза труден и требует комплексного обследования в обычном медицинском учреждении.