Ношение контактных линз в течение длительного времени или во время сна может препятствовать контакту роговицы с воздухом, что приводит к недостатку кислорода в глазах, подобно «реакции плато» человеческого организма, что приводит к покраснению глаз, боли в глазах и нечеткости зрения. Длительное ношение контактных линз может привести к синдрому сухого глаза. Белки, оседающие на контактных линзах, могут вызвать аллергическую реакцию, известную как «макропапиллярный конъюнктивит», который характеризуется зудом, жжением в глазах и густыми гнойными выделениями. Неправильное снятие контактных линз или ношение контактных линз, не соответствующих роговице, может вызвать истирание эпителия роговицы и даже вторичные бактериальные и амебные инфекции, что приводит к необратимой потере зрения. Длительное ношение контактных линз может также вызвать паралич нервных окончаний в роговице, что приводит к ухудшению восприятия роговицы.