Специфическое лечение вторичной аменореи заключается в определении причины аменореи и последующей разработке плана лечения в зависимости от причины. Существует два наиболее распространенных клинических фактора: во-первых, органические поражения, в основном связанные с перенесенными пациенткой операциями на матке, такими как повреждение эндометрия или спайки, вызванные абортом или кюретажем. После гистероскопии можно выбрать гистероскопическую электрохирургию, а после электрохирургии можно добавить эстроген, прогестин и аспирин, а также китайскую медицину, чтобы способствовать восстановлению эндометрия. Во-вторых, фактором может быть эндокринное расстройство, например, гипофункция яичников, приводящая к аменорее. Пациентки могут выбрать для лечения эстроген и прогестерон, такие как тоник, прогестерон или Кломид, в зависимости от конкретной ситуации гипофункции яичников.