Основным методом лечения мужской эпилепсии является прием противоэпилептических препаратов. В соответствии с типом припадков и синдромом эпилепсии выбирают разумные противоэпилептические препараты, при выборе препаратов следует учитывать влияние на мужскую половую функцию и половые гормоны, например, фенитоин натрия, фенобарбитал, карбамазепин могут снижать половые гормоны, что легко приводит к снижению мужского либидо и импотенции, поэтому для молодых мужчин-эпилептиков следует избегать выбора вышеперечисленных препаратов. Новые противоэпилептические препараты, такие как вальпроат натрия, ламотриджин и окскарбазепин, не влияют на половую функцию мужчин-пациентов с эпилепсией и могут применяться с уверенностью. Если у мужчин-пациентов с эпилепсией наблюдается снижение половой функции, можно применять тестостерон, причем тестостерон не влияет на степень припадков или частоту припадков у мужчин с эпилепсией.