Величина вреда от липомы головного мозга зависит от расположения липомы и от того, вызывает ли она значительные клинические симптомы, которые обычно не очень опасны. Примерно у трети пациентов с липомами головного мозга нет никаких симптомов, а у остальных симптомы обычно связаны с размером и расположением липомы, например, большие липомы в мозолистом теле обычно вызывают судороги, а липомы, прилегающие к желудочковой системе, могут вызывать гидроцефалию. Поэтому тяжесть липомы часто зависит от клинических симптомов, которые она вызывает. При наличии длительной эпилепсии она более опасна, тогда как пациенты с бессимптомными и легкими симптомами страдают меньше. Пациентам с липомой головного мозга рекомендуется оперативно обращаться за медицинской помощью и проводить активное лечение под руководством врача, чтобы избежать задержек.