Некоторые типы ВПЧ являются основной причиной рака шейки матки, и почти у всех женщин в какой-то момент развивается инфекция ВПЧ, но рак шейки матки развивается у очень немногих, а иммунная система большинства людей обычно подавляет или уничтожает ВПЧ. ВПЧ-инфекция также является фактором высокого риска развития рака ротоглотки, а также связана с развитием рака анального отверстия, вульвы, влагалища и пениса.