Основным методом лечения пациентов с шанкром является медикаментозное лечение. Наиболее часто используемые препараты — пенициллин и цефалоспорин. Пенициллин является препаратом выбора. Обычно используется бензатин пенициллин 2,4 млн ЕД, разделенный на две стороны ягодицы внутримышечно, применение 1~3 раза; или прокаин пенициллин G и водный пенициллин G 1,2 млн ЕД внутримышечно, непрерывное введение 10~14 дней.
Цефтриаксон в последние годы зарекомендовал себя как высокоэффективный препарат против СП (спирохет сифилиса) и может быть использован как препарат выбора для лиц с аллергией на пенициллин, применяя 1,0-2,0 г/день внутримышечно или внутривенно в течение 10-14 дней. Тетрациклины и макролиды менее эффективны, чем пенициллин, и обычно используются в качестве альтернативных терапевтических средств для пациентов с аллергией на пенициллин, обычно также требуя 14 дней подряд перорального приема.