Гепатиты А и Е являются кишечными инфекциями и передаются в основном фекально-оральным путем, который часто называют путем «изо рта в рот». Фекально-оральная передача может происходить различными путями. Она часто происходит в районах с плохими санитарными условиями и тесным жильем; в сельской местности она особенно вероятна, когда фекалии не удаляются должным образом. Передача вируса через воду и пищу — основные пути передачи при вспышках и эпидемиях гепатита А. Вирус гепатита А часто может передаваться через сточные воды и фекальное загрязнение различных источников воды, таких как колодцы, пруды, реки, водопроводная вода и плавательные бассейны, вызывая эпидемию; пищевая передача происходит в результате прямого загрязнения пищи или загрязнения сточными водами, особенно водных продуктов, таких как моллюски, устрицы, грязевые ковчеги и крабы, которые очень восприимчивы к загрязнению и играют важную роль в пищевой передаче гепатита А. Например, во время эпидемии гепатита А в Шанхае с января по апрель 1988 года (с 300 000 случаев) число заражений гепатитом А составило 1 000. Например, эпидемия гепатита А в Шанхае с января по апрель 1988 года (с 300 000 заболевших) была вызвана употреблением в сыром виде ковчегов, зараженных вирусом гепатита А. Загрязнение питьевой воды является основным путем передачи гепатита Е. Сообщалось, что пандемия гепатита Е в Нью-Дели (Индия) с 1 декабря 1955 года по 20 января 1956 года с 97 000 случаев среди населения 1,7 миллиона человек, включая 29 300 случаев желтушного гепатита, была подтверждена эпидемиологическими расследованиями как вызванная серьезным загрязнением источников воды на водопроводных станциях бытовыми стоками. Повседневный контакт является основным способом передачи спорадического начала гепатита А и Е, обычно через загрязненные руки, посуду, пищевую утварь, игрушки, постельные принадлежности, одежду и т.д., прямо или косвенно через рот. Гепатит А обычно не передается через кровь. Иногда может возникнуть посттрансфузионный гепатит А, когда донор крови находится в поздней латентной фазе виремии, но такие случаи редки. Перинатальная передача гепатита А не происходит, и беременные женщины с гепатитом А не заражают своих плодов, а тератогенных эффектов не наблюдалось. На сегодняшний день нет доказательств того, что гепатит Е может передаваться внекишечным путем.