Биопсия запрещена при опухолях гладкой мускулатуры пищевода, главным образом для того, чтобы предотвратить любое влияние на последующее хирургическое лечение. При осмотре опухоли гладкой мускулатуры пищевода с помощью эзофагоскопии она выглядит в основном как круглое или овальное образование, выступающее в просвет, поверхностная слизистая обычно не повреждена, образование может перемещаться под слизистой и может быть пропущено, если опухоль небольшая.
Поэтому биопсию слизистой не следует проводить во время пищеводной биопсии, чтобы избежать травмы и прилипания слизистой к опухоли, что может затруднить последующее хирургическое удаление.