Большинство анальных свищей, по клиническим наблюдениям, долгое время остаются нераковыми, но очень немногие из них могут стать раковыми. Причинами этого являются: 1) длительная хроническая воспалительная стимуляция, которая иногда приводит к аномальной пролиферации тканей и дальнейшее развитие может привести к злокачественной трансформации; 2) некоторые бактериальные инфекции, такие как инфекции Pseudomonas aeruginosa или Mycobacterium tuberculosis, которые остаются без лечения, могут привести к раку; и 3) длительное использование большого количества различных лекарственных препаратов местного действия, которые могут привести к раку. Хотя частота возникновения рака невелика, он более опасен, когда возникает. Поэтому анальные свищи следует лечить своевременно, чтобы предотвратить возникновение раковых изменений.