Большинство анальных свищей не становятся раковыми после длительного клинического наблюдения, но очень небольшое количество анальных свищей может стать раковыми. Причинами этого являются: (1) Длительная хроническая воспалительная стимуляция иногда приводит к неоднородной пролиферации тканей, и дальнейшее развитие может привести к злокачественной трансформации. (2) Некоторые бактериальные инфекции, такие как Pseudomonas aeruginosa или Mycobacterium tuberculosis, могут привести к раку. (3) Длительное использование различных препаратов местного действия может привести к раку. Хотя частота возникновения рака невелика, он более вреден, когда возникает. Поэтому анальный свищ следует лечить своевременно, чтобы предотвратить возникновение рака.