Лечение пациентов с расщелиной губы и неба представляет собой систематический проект, включающий ортодонтическое лечение на протяжении всего периода. Для пациентов с полной расщелиной губы и неба лечение назоальвеолярной формовкой (PNAM) может быть проведено до исправления расщелины губы; ортогнатическое лечение может быть проведено в раннем смешанном прикусе, а также лечение по упорядочению морфологии дуги до операции костной пластики; и обычное ортодонтическое лечение может быть проведено после операции костной пластики (поздний смешанный прикус или ранний постоянный прикус). Большинство пациентов получили значительные результаты при вышеуказанной последовательности лечения, и часто можно обойтись без ортогнатической хирургии. Для некоторых пациентов с тяжелыми нарушениями развития челюстей ортодонтическое лечение перед ортогнатической операцией проводится в возрасте около 16 лет.