Лучшее время для лечения моксибустионом зависит от состояния пациента и не может быть обобщенным. Моксибустион можно использовать для лечения болезней, улучшения здоровья, оживления кровообращения, согревания меридианов и рассеивания холода. Для общего ухода и поддержания здоровья, а также при общих заболеваниях лучшее время для применения моксибустиона — утро, когда естественная энергия ян достигает своего пика и моксибустион лучше всего воздействует на организм. При некоторых специфических заболеваниях, таких как бессонница, акупунктура и моксибустион рекомендуются в сумерках или непосредственно перед сном для достижения наилучших результатов. В случае острого начала заболевания требуется немедленное лечение. Кроме того, моксибустию следует проводить на определенном расстоянии от тела, не слишком близко, чтобы избежать ожогов, не мыть руки холодной водой и не принимать ванну сразу после моксибустии, не проводить моксибустию в течение часа после еды и не проводить моксибустию при простуде или лихорадке.