Бородавки могут быть белого, розового или серого цвета, а их поверхность может быть везикулярной, сочащейся, изъязвленной, кровоточащей или инфицированной. Вначале поражения представляют собой одиночные, множественные или скопления мелких красноватых гранул с мягкой текстурой и слегка острым кончиком, иногда настолько мелких, что они неразличимы невооруженным глазом. Позже очаги увеличиваются в размерах и могут иметь папиллярную, цветную или корональную форму. У мужчин они возникают на сосках, венечной борозде, препуции, уретре, половом члене и промежности, а у женщин — на больших и малых половых губах, отверстии влагалища, клиторе, влагалище, шейке матки, промежности и перианальной области. У гомосексуалистов он возникает в анусе и прямой кишке. У некоторых пациентов он может возникать в других местах, помимо анальных гениталий, таких как рот, подмышки, грудь и ногти.