Большинство абсцессов в корнях зубов не проходят сами по себе. Абсцессы в корнях зубов обычно являются признаком хронической периапикальной инфекции и должны лечиться незамедлительно, чтобы предотвратить их дальнейшее развитие. Наиболее распространенной причиной периапикальной инфекции является распространение инфицированного материала из корневого канала через апикальное отверстие корня в периапикальную ткань, вызывая бактериальную инфекцию, которая обычно не заживает сама по себе без лечения. Заболевание в основном вызывается бактериями в некротической ткани пульпы внутри корня. Если не удалить инфицированную некротическую ткань, источник инфекции всегда будет присутствовать, и даже если острые периапикальные симптомы будут устранены приемом противовоспалительных препаратов, оставшиеся бактерии все равно будут размножаться и развиваться, приводя к повторному образованию периапикального воспаления. Поэтому, когда в корне зуба появляется абсцесс, его следует лечить с помощью разреза абсцесса в обычном стоматологическом отделении больницы, а гной следует дренировать и лечить противовоспалительными препаратами, чтобы контролировать воспаление.