Несмотря на то, что бородавки часто встречаются в клинической практике, нередки случаи ошибочного диагноза, что приводит к психическому стрессу, физическому ущербу и финансовому бремени для пациентов. Существует два типа ошибочной диагностики бородавок: ошибочная диагностика бородавок как других заболеваний и ошибочная диагностика не бородавок как бородавок. Первый вариант реже встречается в клинической практике, а второй — чаще. Диагноз бородавок основывается на наличии папиллярных, цветных или корпускулярных наростов на гениталиях, в промежности и анальной области, а также на истории нечистого полового акта.