Кашель с желтой мокротой чаще всего клинически связан с воспалением дыхательных путей, вызванным гнойными бактериальными инфекциями, включая острые инфекции верхних дыхательных путей, бронхит, пневмонию и даже абсцессы легких. Однако сам по себе симптом откашливания желтой мокроты не свидетельствует о наличии только бактериальной инфекции, поскольку бывает и так, что при инфекции верхних дыхательных путей наиболее распространенным возбудителем все же является вирус, а по мере снижения сопротивляемости организма пациента может возникнуть вторичная бактериальная инфекция, и в это время происходит смешанная инфекция, включающая и бактерии, и вирус. Поэтому при откашливании желтой мокроты могут присутствовать другие патогенные инфекции, например, вирусы, и в это время можно провести анализ крови и даже взять культуру патогенов из желтой мокроты, например, выделить вирусы, чтобы уточнить причину.