Прогноз при сибирской язве напрямую зависит от наличия своевременной и эффективной диагностики и лечения. Пациенты с сибирской язвой часто находятся в критическом состоянии и могут страдать от сепсиса и инфекционного шока, а иногда и менингита, и если их вовремя не диагностировать и не спасти, они часто умирают от дыхательной и циркуляторной недостаточности после появления острых симптомов.
При своевременном и агрессивном лечении выживают почти все пациенты с кожной формой сибирской язвы; более половины пациентов с легочной формой сибирской язвы выживают; и 60% пациентов с желудочно-кишечной формой сибирской язвы выживают.