Инфекционные камни образуются, когда патогенные бактерии заражают мочевыводящие пути и выделяют уреазу для расщепления мочевины в моче, которая после ряда химических реакций образует камни. Основными компонентами инфицированных камней являются фосфат аммония-магния и карбонат апатита. Существует множество патогенных бактерий, способных выделять уреазу, включая Mycobacterium avium, Mycobacterium pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli и Mycoplasma urealyticum, наиболее распространенной из которых является Mycobacterium oddum. Патогенные бактерии инфицируют мочевыводящие пути и выделяют уреазу, которая расщепляет мочевину на аммиак и углекислый газ. Аммиак соединяется с водой, образуя соли аммония, которые соединяются с магнием и фосфатом в моче, образуя фосфат аммония-магния. Углекислый газ соединяется с водой и образует бикарбонат, делая мочу щелочной. Ионы кальция, фосфат и двуокись углерода в моче соединяются в щелочной среде, образуя карбонат-апатит. Инфицированные камни растут быстрее и часто заполняют почечные протоки, образуя литые камни. Камни, блокирующие протоки, в сочетании с инфекцией, как правило, нарушают функцию почек и поэтому требуют агрессивного лечения, часто требующего хирургического вмешательства для удаления камней. Остаточные камни и инфекция после операции приводят к тому, что камни быстро рецидивируют и снова образуют литые камни. Поэтому камни должны быть максимально удалены во время операции, а послеоперационный контроль инфекций мочевыводящих путей и подкисленной мочи необходим для предотвращения рецидивов и быстрого роста камней.